دوره مجموعه تکنیک های بیان ژن، غنی سازی و سیستم بیولوژی

ساعت آموزش

آموزش مفاهیم آماری مرتبط با آنالیز بیان ژن
آشنایی با محیط نرم افزاری R، نحوه نصب پکیجها بر روی R، آموزش وارد کردن داده ها به R و نحوه گرفتن داده ها
آموزش محاسبات آماری در R، آشنایی با برخی پکیجهای مرتبط مثل limma
آنالیز داده های میکرواری، نحوه آنالیز داده های موجود در GEO و کشیدن نمودارهای مربوط مانند heatmap
آشنایی مقدماتی با لینوکس
آشنایی با آنالیز داده های توالی یابی RNAseq، آموزش پکیج های و ابزار های مرتبط
آموزش آنالیز RNAseq در محیط لینوکس به صورت کدنویسی
آنالیزهای غنی سازی (Enrichment analysis)
آموزش و ترسیم شبکه های پروتئنی توسط Cytoscape و تحلیل شبکه ها
بدست آوردن زیرشبکه های تنظیمی (Gene regulatory network) توسط Cytoscape از شبکه اصلی کشیده شده
رسم و تحلیل شبکه های هم بیانی

محل برگزاری